채점자는 제출받은 파일에 대해서 항상 출력을 [Cell – Run All] 하여 확인할 것이므로 학생은 제출 파일에 출력을 포함시킬 이유가 없다. 여러 학생들이 제출한 많은 파일들을 관리해야 하는 채점자는 파일 사이즈가 작은 것을 선호하므로 쎌들의 출력을 삭제한 뒤 제출하도록 요구하는 경우가 많다.
과제 파일을 준비할 때 쎌들을 생성했다가 삭제하는 일이 흔히 있다. 쎌에서 일단 생성해 놓은 객체는 그 쎌을 삭제한 뒤에도 살아 있으므로 다른 쎌에서 그 객체를 사용할 때 이상 없이 잘 작동될 수 있다. 그러므로 제출하기 전에 [Cell – Run All] 하여 출력이 제대로 나오는 것을 확인한다고 해도 이대로 제출하면 안 될 수도 있다. (계산에 사용되는 객체를 생성한 쎌이 삭제되어 있는 경우 문제가 발생한다.)
모든 객체를 삭제한 후 [Cell – Run All] 해서 출력이 제대로 나오는지를 확인해야 한다. 모든 객체를 삭제하려면 rm(list=ls()), 또는 [Kernel – Restart]를 실행하면 된다. 후자는 전자와 달리 쎌의 시작부분에 있는 In [n]:의 n까지 깔끔하게 리셋해 준다.